مدل سازی روابط ساختار-فعالیت (qsar) آنتاگونیست های آدنوزین a1 و هورمون تیروئید 1? و بهینه سازی روش هیدرولیز اسیدی به کمک ریزموج ها (maah) برای اندازه گیری سریع بیومارکرهای اکسایش پروتئین ها

بخش اول در این مطالعه از روش های ساختار-فعالیت برای پیش بینی ثابت تمایل 45 ترکیب به عنوان آنتاگونیست های گیرنده آدنوزین a1 استفاده شد. پس از محاسبه توصیف گرها با استفاده از نرم افزار dragon، از الگوریتم ژنتیک برای گزینش توصیف گرها و از روش فازی-عصبی برای مدل سازی استفاده شد. نهایتا دو توصیف گرgats4v و belv7 با روش الگوریتم ژنتیک و حذف از آخر انتخاب شد و مدل فازی-عصبی توسط این دو توصیف گر بهینه گردید. برای ارزیابی مدل های حاصل از نظر سازگاری و قابلیت پیش گویی از روش های ارزیابی متقاطع به عنوان روش ارزیابی داخلی و از روش های ترتیبی و تصادفی به عنوان روش های ارزیابی خارجی استفاده شد. نتایج نشان می دهد که روش فازی-عصبی در مقایسه با دو روش شبکه عصبی شعاعی و برازش خطی چندگانه با تنها دو توصیف گر در مقایسه با مدل شبکه عصبی شعاعی با چهار توصیف گر و برازش خطی چندگانه با شش توصیف گر، مدل ساده تر با قابلیت پیش گویی بهتری ایجاد می کند. در یک مطالعه ساختار-فعالیت دیگر، غلظت بازدارندگی 50% (ic50)تعدادی از لیگاندهای گیرنده هورمون تیروئید ?1 با استفاده از روش فازی-عصبی و شبکه عصبی شعاعی، مدل سازی و پیش گویی گردید. از روش الگوریتم ژنتیک و حذف از آخر 7 توصیف گر انتخاب شد که نهایتا مدل فازی-عصبی با دو توصیف گر (scbo و eeig08x) و مدل شبکه عصبی شعاعی با سه توصیف گر (scbo و eeig08 و behe1) ساخته شد. روش های ارزیابی متقاطع، ترتیبی و تصادفی برای بررسی سازگاری مدل حاصل و توانایی پیش گویی آن به کار رفت. نتایج بیانگر این است که شبکه فازی-عصبی و شبکه عصبی شعاعی توانایی ارائه مدل های ساده تر و بهتری نسبت به روش برازش خطی چندگانه را دارند. بخش دوم در این کار، یک روش بسیار سریع و کارآمد جهت اندازه گیری دو بیومارکر اکسایش پروتئین ها با استفاده از هیدرولیز اسیدی به کمک ریزموج ها (maah) ارائه شده است. ابتدا سمی آلدئید های آمینو آدیپیک و گلوتامیک ( ggsو aas) به عنوان بیومارکر های اکسایش پروتئین آلبومین گاوی، سنتز و خالص سازی شد تا به عنوان استاندارد مورد استفاده قرار گیرد. سپس پروتئین پروتئین آلبومین گاوی در معرض مواد اکسنده قرار داده شد و پس از مشتق سازی با آمینو پارا بنزوئیک اسید (aba) از امواج ریزموج برای هیدرولیز این بیومارکرهای پروتئین اکسید شده استفاده شده؛ سپس اندازه گیری آنها توسط روش کروماتوگرافی مایع-اسپکترومتری جرمی (lc/ms) انجام شده است. مشتق سازی گروه های سمی آلدئید با aba موجب می شود بیومارکرهای مذکور از هرگونه تخریب و آسیبی محافظت شوند. پارامتر های موثر در فرایند هیدرولیز نظیر دما، زمان تابش، غلظت اسید و توان امواج ریزموج بهینه شده است. در مقایسه با روش مرسوم هیدرولیز که گرمادهی به مدت 18-24 ساعت در دمای 110 درجه است، maah تنها 2-10 دقیقه طول می کشد و بازدهی انجام فرایند هیدرولیز نیز 3-5 برابر بیشتر است. تکرار پذیری، سرعت بیشتر، سهولت انجام آزمایش های موازی، بازدهی بالاتر و کمتر بودن واکنش های جانبی از مزایای روش maah در مقایسه با روش مرسوم گرمادهی می باشد.